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	Provedor de dados ArchiMer (2) Autor Gourmelon, Michele (2) Joubrel, Rozenn (2) Caprais, Marie-paule (1) Le Mennec, Cecile (1) Mieszkin, Sophie (1) Yala, Jean Fabrice (1) Mais... Palavra-chave Bacteroidales (2) 16S rRNA gene (1) Bactériophages F +ARN spécifiques (1) Coquillage (1) E. coli (1) Faecal contamination (1) Génotypage (1) Littoral (1) Marqueurs de contamination fécale (1) Microbial Source Tracking (1) PCR conventionnelle (1) Sewage and manure (1) Mais... Tipo do documento Text (2) Ano 2010 (1) 2008 (1) País France (2) Idioma Francês (1) Inglês (1)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 2 Primeira ... 1 ... Última Identification de l'origine de la contamination observée en baie de La Baule : Première partie de l'étude ArchiMer Caprais, Marie-paule; Gourmelon, Michele; Le Mennec, Cecile; Joubrel, Rozenn. Afin d'améliorer la qualité sanitaire des coquillages du secteur La Baule - Le Pouliguen, la Communauté d'Agglomération CAP Atlantique a mis en place un programme d'étude pour identifier les sources de pollution sur ce secteur et initier des actions permettant de limiter les apports d'origine fécale aux coquillages. Dans le cadre de cette présente étude, de juin 2006 à décembre 2007, deux méthodes d'identification de l'origine de la contamination fécale en cours de développement au laboratoire de microbiologie d'Ifremer de Brest, ont été appliquées sur des lots de coquillages (n=87 ; 6 sites) et des échantillons d'eaux (n=40 ; 7 localisations). La première méthode consistait à rechercher par PCR conventionnelle les gènes codant les ARN ribosomiques (ARNr)... Tipo: Text Palavras-chave: Bacteroidales; Bactériophages F +ARN spécifiques; Marqueurs de contamination fécale; E. coli; Génotypage; PCR conventionnelle; Coquillage; Littoral. Ano: 2008 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00622/73452/72691.pdf Phylogenetic analysis of Bacteroidales 16S rRNA gene sequences from human and animal effluents and assessment of ruminant faecal pollution by real-time PCR ArchiMer Mieszkin, Sophie; Yala, Jean Fabrice; Joubrel, Rozenn; Gourmelon, Michele. Aims: The aims of this study were to evaluate the host-specific distribution of Bacteroidales 16S rRNA gene sequences from human- and animal-related effluents and faeces, and to define a ruminant-specific marker. Methods and Results: Bacteroidales 16S rRNA gene clone libraries were constructed from samples of effluent (sewage, bovine manure and pig slurry) and faeces (human, bovine, pig and wild bird), using PCR primers targeting order Bacteroidales. The phylogenetic analysis revealed six main distinct human-, bovine-, pig- and wild bird-specific clusters. From the bovine-specific cluster II, we designed a ruminant-specific marker, Rum-2-Bac, and this showed 97% sensitivity (n = 30) and 100% specificity (n = 40) when tested by TaqMan (R) real-time PCR.... Tipo: Text Palavras-chave: 16S rRNA gene; Bacteroidales; Faecal contamination; Microbial Source Tracking; Sewage and manure. Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/11156/8235.pdf Registros recuperados: 2 Primeira ... 1 ... Última

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